Tanaman kedelai merupakan tanaman yang dibudidayakan serta memiliki manfaat yang bermacam-macam. Dengan meningkatnya jumlah penduduk di Indonesia, maka meningkat pula jumlah permintaan produksi kedelai. Akan tetapi tanaman tidak bisa terlepas dari hama dan penyakit yang menyerang, sama halnya dengan tanaman kedelai. Ketika hama dan penyakit menyerang, dampak yang terjadi ialah penurunan hasil produksi serta kualitas kedelai juga. Dengan keterbatasan penyuluh lapangan mengakibatkan terhambatnya para petani dalam mengetahui cara pengendalian jika terserang hama maupun penyakit. Oleh karena itu, dibutuhkan sistem yang mampu mendiagnosa hama maupun penyakit yang menyerang tanaman kedelai. Pada penelitian ini dirancangan sistem pakar berbasis web dengan menggunakan basis aturan dan metode certainty factor untuk membantu petani dalam mendiagnosa hama maupun penyakit pada kedelai. Aplikasi ini berisi tentang informasi tanaman kedelai serta cara mendiagnosanya. Dalam pengujian menggunakan menggunakan metode certainty factor, sistem menggunakan data uji sebanyak 20 data. Tingkat keakuraisaan yang dihasilkan dipengaruhi oleh referensi pengetahuan yang dimiliki oleh pakar. Semakin spesifik gejala serta tingginya nilai kepercayaan terhadap suatu gejala, maka akan semakin tinggi tingkat akurasinya.