Pemilihan keminatan laboratorium dengan menggunakan sistem rekomendasi berdasarkan nilai mata kuliah mahasiswa dipercaya dapat membantu meningkatkan tingkat efisiensi dan efektivitas mahasiswa dalam permasalahan pemilihan laboratorium untuk penunjang penyusunan skripsi mahasiswa. Saat ini mahasiswa umumnya dalam memilih keminatan laboratorium hanya dengan menggunakan perasaan atas keminatan pribadi terhadap kemampuan dalam bidang-bidang mata kuliah tertentu. Namun fenomena yang muncul yaitu, bahwa dalam pemilihan keminatan laboratorium di PTIIK Universitas Brawijaya adalah masih dapat terjadinya perubahan pemikiran mahasiswa terhadap keminatan laboratorium skripsinya yang telah dipilihnya. Kesalahan dalam pengambilan mata kuliah pilihan pada semester-semester sebelumnya dan yang secara langsung mengakibatkan pengerjaan skripsinya terhambat karena masih terdapat mata kuliah pilihan sebagai penunjang penyusunan skripsi yang belum diambil dan berkemungkinan untuk memulai dari awal lagi. Perkembangan teknologi serta implementasi teknologi informasi dalam dunia pendidikan dapat digunakan dalam hal ini. Untuk optimalisasi proses pemilihan keminatan laboratorium, permasalahan dalam kurangnya panduan serta perbandingan khusus dalam pemilihan dapat diminimalisir dengan memanfaatkan suatu sistem pakar. Perancangan sistem rekomendasi pendukung keputusan dengan menggunakan metode Certainty Factor dapat membantu dalam proses pemilihan laboratorium yang sesuai dengan keminatan dan kemampuan mahasiswa serta membantu dalam mencari rekomendasi yang terbaik. Berdasarkan hasil pengujian menunjukkan hasil tingkat akurasi implementasi sistem sebesar 76.67% dimana dapat dikatakan perancangan sistem ini dapat digunakan sebagai referensi tambahan bagi mahasiswa dalam pemilihan keminatan laboratoriumnya.