Negara Indonesia merupakan negara agraris. Salah satu tanaman yang sering dibudidayakan oleh petani adalah tanaman kedelai. Namun, petani seringkali mengalami kegagalan panen dikarenakan tidak mengetahui penyakit tanamannya dan kurangnya sumber daya manusia yang ahli dalam bidang tersebut. Untuk mengetahui secara tepat jenis penyakit yang menyerang tanaman kedelai tersebut, memerlukan seorang ahli/pakar pertanian. sedangkan jumlah pakar pertanian terbatas dan tidak dapat mengatasi permasalahan petani dalam waktu yang bersamaan. Sehingga diperlukan suatu program yang mempunyai kemampuan seperti seorang pakar, yang di dalam program ini berisi pengetahuan keahlian seorang pakar pertanian mengenai penyakit dan gejala tanaman kedelai. Pada penelitian ini dirancang aplikasi berbasis web menggunakan basis aturan (rule-based reasoning) dengan metode classical probability yang dimaksudkan untuk membantu petani dalam mendiagnosa penyakit tanaman kedelai. Dengan fitur yang berbasis web yang dimiliki, aplikasi untuk diagnosa penyakit tanaman kedelai yang telah dibangun dapat digunakan sebagai alat bantu untuk diagnosa penyakit tanaman kedelai dan dapat diakses oleh petani dimanapun juga untuk mengatasi persoalan keterbatasan jumlah pakar pertanian dalam membantu petani mendiagnosa penyakit tanaman kedelai. Implementasi aplikasi ini dibuat dengan menggunakan Macromedia Dreamweaver 8 dan untuk penyimpanan datanya menggunakan MySQL. Pengujian yang digunakan yaitu pengujian akurasi. Hasil pengujian akurasi sebesar 85 % yang menunjukkan bahwa program berjalan dengan baik pada 20 sampel kasus.